【摘 要】
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Domain insertions and deletions lead to variations in the domain architectures of the proteins from their common ancestor. In this work, we investigated four gr
【机 构】
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The Key Laboratory of the Ministry of Education for Biodiversity Science and Ecological Engineering
【出 处】
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基因组、蛋白质组与生物信息学报（英文版）
【基金项目】
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国家高技术研究发展计划(863计划);教育部优秀青年教师资助计划;北京师范大学校科研和教改项目
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Domain insertions and deletions lead to variations in the domain architectures of the proteins from their common ancestor. In this work, we investigated four groups of the RhoGEF-containing proteins from different organisms with domain architectures RhoGEF-PH-SH3, SH3-RhoGEF-PH, RhoGEF-PH, and SH3-RhoGEF defined in the Pfam database. The phylogenetic trees were constructed using each individual domain and/or the combinations of all the domains. The phylogenetic analysis suggests that RhoGEF-PH-SH3 and SH3-RhoGEF-PH might have evolved from RhoGEF-PH through the insertion of SH3 independently, while SH3-RhoGEF of proteins in fruit fly might have evolved from SH3-RhoGEF-PH by the degeneration of PH domain.
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