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采用稀释平板记数法对新疆古尔班通古特沙漠南缘的自然荒漠地、人工植被改造地以及二者的过度带3块不同程度盐碱地中的细菌、放线茵、真菌数量进行分析，研究地表植被与土壤微生物区系分布的关系。结果表明：在荒漠土壤改造过程中，植物种类增加，植被多样性总体水平提高。3类微生物数量都有不同程度的增加，其中细菌和放线茵在30cm以下的深层土壤中增量较大；真菌有由中层向表层和深层迁移的趋势；真菌／细菌（B／F）值增加了2倍。从微生物角度来评价，表明种植耐盐植物（柽柳、梭梭）作为盐碱地改良的一项有效措施能够很好的改良荒漠土壤。