【摘 要】
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目的 了解深圳市坪山区手足口病的病原谱和柯萨奇病毒A组6型(CVA6)基因特征.方法 收集坪山区2019年疑似手足口病的病例粪便或肛拭子样本,采用Real-time RT-PCR法进行肠道病毒
【机 构】
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深圳市坪山区疾病预防控制中心,广东深圳518118;深圳市疾病预防控制中心
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目的 了解深圳市坪山区手足口病的病原谱和柯萨奇病毒A组6型(CVA6)基因特征.方法 收集坪山区2019年疑似手足口病的病例粪便或肛拭子样本,采用Real-time RT-PCR法进行肠道病毒核酸检测分型,选取其中的优势型别CVA6阳性样本进行VP1片段全长序列扩增、序列测定和系统进化分析.结果 2019年共检测手足口病病例样本184份,检出肠道病毒通用型阳性165份,总阳性率为89.67％;其次为CVA6阳性120份(72.73％)、CVA16阳性40份(24.24％)、CVA10阳性8份(4.85％),其他肠道病毒阳性3份(1.82％),未检出肠道病毒71型(EV71).同源性及系统进化分析显示,2019年深圳市坪山区24株CVA6 VP1基因核苷酸和氨基酸同源性分别为93.4％～99.9％和98.4％～100.0％,基因型为D3亚型,24株病毒VP1序列均分布于D3a.2分支上.结论 2019年坪山区手足口病病原体以CVA6为主,D3a.2为其优势流行株.
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