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目的了解乌鲁木齐市手足口病发病可能的危险因素，为制定防控措施提供科学依据。方法从"中国疾病预防控制信息系统"中选取乌鲁木齐市各医疗机构报告的手足口病临床诊断或实验室诊断病例155例作为病例组。同一个时间段，随机抽取324例未患手足口病健康儿童作为对照组，采用同一的调查表进行调查，采用SPSS13.0统计软件进行数据分析。结果患有基础性疾病（OR=4.710，95%CI：1.969~11.265）、经常咬手指头（OR=4.564，95%CI：2.647~7.871）、近10d公共场所暴露史（OR=1.961，95%CI：1.189~3.234）、近10d手足口病接触史（OR=43.470，95%CI：5.526~341.929）为发病独立危险因素、经常清洗玩具（OR=0.503，95%CI：0.309~0.820）、外出回来洗手（OR=0.534，95%CI：0.284~1.005）为独立保护因素。结论间接接触是乌鲁木齐市手足口病发病的主要危险因素，减少公共场暴露机会，养成良好卫生习惯，加强健康教育是预防与控制手足口病的有效途径。