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2008年9月-2009年1月,全球分离到甲型流感(H1N1)、甲型流感(H3N2)、甲型流感(H5N1)和乙型流感病毒.全球流感疫情比上年同期轻,但一些欧洲国家疫情较重.南半球许多国家仍有流感疫情.北半球大部分地区疫情较轻.对流感病毒分离株的抗原性和遗传学分析表明,大多数甲型流感(H1N1)病毒与2008-2009年疫苗株A/布里斯班/59/2007密切相关.新近分离株的血凝素属于以A/布里斯班/59/2007和A/香港/2652/2006为代表的两个不同进化支.大多数新近分离的甲型流感(H3N2)病毒的抗原性与疫苗病毒A/布里斯班/10/2007和A/乌拉圭/716/2007相似,系统发生分析属于A/布里斯班/10/2007进化支.B/山形/16/88谱系的大多数病毒与疫苗株B/佛罗里达/4/2006和B/布里斯班/3/2007密切相关.