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在杂交棉花制种过程中，往往因母本去雄不彻底、高温转育、人为掺杂等原因而导致种子纯度不高，寻找快速准确的纯度检测方法是杂交棉花种子生产和经营急需解决的问题。本研究以杂交棉铜杂411及其双亲为材料，采用SSR分子标记技术筛选出双亲间的多态性产物NAU5120，并对铜杂411种子的纯度进行了检测，为杂交棉花铜杂411的种子纯度鉴定提供了一个准确、稳定、快捷、实用的检测方法。