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本文选择5个水稻SNPs位点为对象，研究凝胶组成和电泳条件等对PCR—SSCP检测SNPs的影响。发现凝胶浓度、交联度、甘油和电泳温度等均可明显影响DNA单链分子迁移率，且对不同DNA单链分子的影响程度不同。因此。可以通过调节凝胶浓度、交联度、甘油和电泳温度等提高PCR-SSCP检测水稻SNPs的分辨率及效果。在一定条件下，较低交联度和4°电泳条件检测SNPs的效果更好。