中国明对虾肝胰腺细小病毒全基因组的克隆及序列分析

• 作 者: 张峥 黄健 高强 成君军 王明森
• 机 构: 农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室,上海海洋大学,中国科学院海洋研究所
• 出 处: 中国水产科学
• 发表日期: 2011年1期
• 关键词: 肝胰腺细小病毒(HPV) 中国明对虾 基因组序列 hepatopancreatic parvovirus（HPV） Fenneropenaeus chinen
• 基金项目: 国家863计划项目（2006AA100306）, 国家重点基础研究发展计划项目（2006CB101801）, 农业部公益性行业（农业）科研专项（200803012）, 国家虾现代产业技术体系（nycytx-46）岗位专家经费项目

中国明对虾肝胰腺细小病毒是一种单链、线性DNA病毒。本研究利用DNA末端加尾和嵌套PCR首次完成了对虾肝胰腺细小病毒（hepatopancreatic parvovirus,HPV）中国分离株（HPV-Pc）全基因组序列的测定,研究结果表明,HPV-Pc株（GenBank登录号GU371276）的全基因组由6 085个核苷酸组成,包含3个开放阅读框（ORF）（分别代表ns1、ns2和cp基因）和2个非编码区。ORF1、ORF2和ORF3分别编码由427、578和821个氨基酸组成的蛋白,分子量分别为50.