大肠杆菌SD序列与基因表达水平的关系

来源 :内蒙古大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:gumozaoshi
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依据基因表达水平的理论预测方法从1373个大肠杆菌基因中选出了73个甚高表达基因和100个甚低表达基因.研究了这两类基因编码区起始密码子ATG前-1到-21位点(包含SD序列)的碱基构成与基因表达水平的关系.结果表明,SD序列中的富嘌呤区(约在-7到-12位点)G和T的概率分布曲线中心到ATG的距离(记为LH)与基因表达水平有明显的关系.甚高表达基因LH约为10,甚低表达基因的LH约为8;另外在-1位点处,高低表达基因的T或C出现的概率有明显的差异 Based on the theoretical prediction of gene expression, 73 highly expressed genes and 100 very low expressed genes were selected from 1373 E. coli genes. The relationship between the base composition and the gene expression level of ATG from -1 to -21 (including the SD sequence) of ATG in the coding region of these two genes was studied. The results show that there is a clear relationship between the distance from the center of ATG to the ATG (denoted LH) in the G-sequence of the purine (about -7 to -12 sites) in the SD sequence and the gene expression level. The highly expressed gene LH was about 10, and the very low expressed gene LH was about 8. In addition, there was a significant difference in the probability of occurrence of T or C at the -1 locus
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