【摘 要】
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急性出血性结膜炎(Acute hemorrhagic conjunctivitis,AHC)是目前人类最常见的眼病之一,柯萨奇病毒A组24型变异株(Coxsackievirus A24 variant,CV-A24v)是近年来报道引起该病
【机 构】
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国家脊髓灰质炎实验室,世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室,国家卫生健康委员会生物安全重点实验室,国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,北京1022
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急性出血性结膜炎(Acute hemorrhagic conjunctivitis,AHC)是目前人类最常见的眼病之一,柯萨奇病毒A组24型变异株(Coxsackievirus A24 variant,CV-A24v)是近年来报道引起该病的主要病原体.本研究选取10株来自江西省2010年AHC暴发疫情的CV-A24v,采用特异性引物扩增并测定其全基因组序列.对该10条CV-A24v的全基因组序列进行系统发育分析以及重组分析,计算本研究测定的江西10条以及GenBank中所有22条CV-A24v的全基因组序列的氨基酸置换熵值,并预测其正向选择位点.结果表明,在江西10条CV-A24v基因组序列中未检测到重组.基于全基因组序列构建的最大似然树表明江西10株CV-A24v属于GIV基因型,且分处于两条传播链.对上述32条CV-A24v序列的氨基酸置换熵值计算,共得到25个易突变位点(熵值＞0.6),易突变概率最高的区段为2A区.基于Datamonkey中FUBAR和FEL模型分析,发现位于结构蛋白VP2区的234位氨基酸为两种模型共同获得的CV-A24v的正向选择位点.本研究分析了江西10株CV-A24v的全基因组序列特征,为CV-A24v引起的AHC防控工作提供了基础资料.
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