1株鸭源Ⅰ类新城疫病毒分离株F和HN基因的分子特性分析

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采用RT-PCR技术对I类新城疫病毒(NDV)09-014分离株完整的融合蛋白(F)基因和血凝素一神经氨酸酶(HN)基因进行了扩增和遗传进化分析.F基因的序列测定结果表明:该分离株F基因全长为1 792 by,可编码553个氨基酸,裂解位点的氨基酸组成为112E-R-Q-E-R-L117,具有典型的新城疫弱毒株特征.同源性分析表明本分离株的F基因与I类新城疫病毒代表毒株之间核苷酸的同源性为93%-95.2%,而与Ⅱ类新城疫病毒代表毒株的同源性较低,介于70.6%-72.4%.HN基因的序列测定结果表明:HN基因全长2 001 bp,可编码616个氨基酸,同源性分析表明本分离株的HN基因与I类新城疫病毒代表毒株之间核苷酸的同源性在92.7%-94.7%之间,而与类新城疫病毒同源性较低,为70.7%Ⅱ-71.5%.根据完整的F基因和HN基因构建的遗传进化树均表明:本分离株在分类地位上属于I类新城疫病毒基因3型,因此I类新城疫病毒的F基因和HN基因具有相似的进化速率.
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