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针对单载波频域均衡(SC-FDE)系统中迭代块判决反馈均衡(IBDFE)算法随迭代次数增加运算复杂度迅速提高的问题,提出了一种低复杂度频域迭代均衡算法。利用均方误差(MSE)准则对检测点误差信号进行分析,对确定的信道增益每次迭代的滤波器系数为定值,并通过在帧结构插入特殊字序列UW作为循环前缀来减小系统开销。理论分析和仿真实验结果表明:本文算法在较高信噪比下比传统的线性均衡性能更好,而在相同迭代次数时接近IBDFE算法性能且比IBDFE算法复杂度大大降低。