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针对虚拟企业伙伴选择过程中传统的属性权重设计方法过多依赖于主观经验的缺点，虚拟企业伙伴选择过程中决策因素多、信息量大、候选投标伙伴数量多等问题，提出一个基于粗糙集和自适应遗传算法的虚拟企业伙伴选择算法．利用粗糙集的知识熵，为潜在伙伴企业的样本数据集建立决策系统，使得在不需要任何先验知识的前提下，得到客观的评价指标的权值．同时，该算法将自适应遗传算法运用于最优伙伴的选择模型中．通过将该算法与标准遗传算法的实验结果对比，证实了该算法的可行性和有效性．