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反转录转座子是真核生物基因组中普遍存在的一类可移动的遗传因子，它们以RNA为媒介，在基因组中不断自我复制。在高等植物中，反转录转座子是基因组的重要成分之一。反转录转座子可以分为5大类型，其中以长末端重复（LTR）类型报道较多。LTR类型由于其首尾具有长末端重复序列，内部含有PBS、PPT、GAG和POL开放阅读框、TSD等结构，可以采用生物信息学软件进行预测。LTR反转录转座子的活性受到自身甲基化和环境因素的影响，DNA甲基化抑制反转录转座子转座，而外界环境的刺激能够激活转座子，从而影响插入位点周边基因的