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对7株赤潮原甲藻28SrDNA 5’端部分序列进行扩增、克隆和序列测定，并从GeneBank上获取14个原甲藻28SrDNA序列，用NJ法和ME法构建了原甲藻属的系统树，并对序列进行分析．结果表明，7株原甲藻28SrDNA扩增序列长度为950-958bp，通过NJ法和ME法构建的系统树完全一致．大部分分离自不同海域的同种原甲藻的序列高度保守，而不同种间在序列高变区却有较大的差异．但来自南海海域的海洋原甲藻（Prorocentrum micans）与分离自其他海域的株系序列差异较大，甚至超出了有些种间的差异