【摘 要】
：
本研究首次构建了马尾松均一化cDNA文库,采用Illumina高通量测序技术对转录组进行了测序,利用生物信息学方法开展基因表达谱的研究、功能基因的预测。EST序列拼接获得83680个
【机 构】
：
林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京林业大学
论文部分内容阅读
本研究首次构建了马尾松均一化cDNA文库,采用Illumina高通量测序技术对转录组进行了测序,利用生物信息学方法开展基因表达谱的研究、功能基因的预测。EST序列拼接获得83680个contig,其中33772个contig被注释为相应的331669对生物学功能,10647个contig被注释具有酶功能。根据KEGGpathway数据库,对马尾松转录组的contig进行Pathway生物学通路的注释和预测,共识别出10647个contig具有对应的1029种酶功能,并关联到135条生物学通路。SSR查找发现,从83680个contig中找到889个SSR位点,占contig总数的比例为1.06%。其中,三核苷酸重复所占比例最高,达到48.37%,其次是六核苷酸重复,为19.12%,比例最低的是四核苷酸重复,仅为4.72%,二核苷酸重复和五核苷酸重复基本相同,分别为14.62%和13.16%。SSR不同重复基元类型中,出现频率最高的为AT/AT,其次是AGC/CTG和AAG/CTT。
其他文献
目的:探讨早期和晚期康复训练对脑卒中后排尿功能障碍康复的影响。方法:126例脑卒中并发排尿功能障碍患者,早期和晚期康复组各63例,早期康复组在神经病学体征稳定后1~4 d开始
目的:探讨持续静脉-静脉血液滤过(CVVH)治疗心脏术后肾衰的护理。方法:通过对27例重症心血管术后并发以急性肾衰为主的多脏器功能衰竭的患者采用CVVH治疗。结果:本组27例采用
本文以云梦秦简为材料考证秦代勘查检验制度,揭示了秦代勘验人员在犯罪现场勘查过程中,善于从多方面搜集形象痕迹和立体痕迹,实行尸身外表检验,重证据、空调查研究,为确定勘
公安机关的角位定位应从根本上改变观念 ,与现代法制文明相适应 ,确立其是一个执法机关和服务部门。对严格、公正、文明执法要把握精神 ,正确认识和落实。
本文围绕浙大网新公司案,结合国际商会国际仲裁院1998年和2012年仲裁规则,以及新加坡有关国际商事仲裁立法与实践,分析了约定适用ICC规则在其他仲裁机构仲裁的仲裁协议的可执
目的评价药学服务对风湿性心脏病左房室瓣狭窄伴心房纤颤患者临床路径的干预效果。方法根据原卫生部颁发的《风湿性左房室瓣狭窄(内科)临床路径》(2010版)设计风湿性心脏病左
＂过一种幸福完整的教育生活＂是新教育实验的核心理念,历经多年广泛的教育实践的洗礼,日臻完善。朱永新教授创建、提倡、普及的这一教育思想,已越来越成为教育界的共识。苏格拉
本文通过对杨属5组代表种并以柳属中旱柳的ITS序列作为参照,用成对比较的方法对杨属21个植物样品的ITS序列比较发现,杨属ITS序列的碱基替换情况是转换数大于颠换数,ITS-1序列