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采用分步傅里叶法求解信号在多信道系统中满足的耦合非线性薛定谔方程组，建立40Gbps多信道通信系统的传输模型，以该模型仿真分析了NRZ码和RZ码的传输性能，并引入时频分析方法分析信号的传输性能。仿真结果表明，RZ码能量集中，误码率低；在40Gbps通信系统中RZ码对PMD有一定的抑制作用，降低了系统OSNR灵敏度的要求，有利于现在的10Gbps的光纤通信系统速率升级到40Gbps。