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根据甘薯〔Ipomoea batatas(Linn.)Lam.〕转录组数据,从甘薯品种福菜薯7-6(Fucaishu 7-6)中克隆获得1个编码查尔酮异构酶的基因,命名为IbCHI;IbCHI基因全长732 bp,GC含量为55.19％,共编码243个氨基酸.生物信息学分析结果表明:在IbCHI基因编码的氨基酸序列第12至第214位包含1个Chalcone结构域;IbCHI蛋白分子式为C1156 H1831 N291 O351 S7,理论相对分子质量为25646.41,理论等电点为pI 5.25,并可能具有1个跨膜螺旋区,定位于细胞核和细胞膜上;其氨基酸序列中包含24个带正电荷和27个带负电荷的氨基酸残基,丙氨酸、丝氨酸、缬氨酸和甘氨酸所占比例较高,半胱氨酸所占比例最低;IbCHI蛋白的不稳定指数和总亲水性平均系数分别为38.49和0.074,表明IbCHI蛋白是一种稳定的亲水性蛋白质;IbCHI蛋白二级结构中,α螺旋、随机卷曲、延伸链和β转角所占比例分别为39.51％、31.69％、20.16％和8.64％.多重比对结果显示:IbCHI基因与同属种类圆叶牵牛(I.purpurea Lam.)和牵牛〔I.nil(Linn.)Roth〕CHI基因编码的氨基酸序列高度相似(相似度90％以上),且在系统发育树上聚为同一支.IbCHI基因启动子区包含启动子基本元件TATA-box和CAAT-box,以及胁迫响应元件、茉莉酸甲酯响应元件和光响应元件等26个顺式作用元件.qRT-PCR分析结果表明:IbCHI基因在供试4个甘薯品种EC15、EC16、福菜薯18(Fucaishu 18)和福菜薯7-6的根、茎、茎尖和叶中均有表达,但其在不同品种和器官间的相对表达量存在明显差异,其中,福菜薯7-6茎和叶中IbCHI基因的相对表达量显著高于其他3个品种.经干旱(质量体积分数30％PEG6000)和盐(0.2 mol·L-1 NaCl)处理后,IbCHI基因的相对表达量随处理时间的延长均呈先下降后上升的趋势,并在处理24 h后该基因的相对表达量显著(P<0.05)升高.综合分析结果表明:甘薯IbCHI蛋白属于Chalcone超级家族,具有较高的保守性;IbCHI基因的表达具有组织和品种特异性,且在调控甘薯对非生物胁迫的响应过程中起重要作用.