硝化微生物富集及其种群结构与基因表达分析

• 作 者: 余晨笛 侯立军 郑艳玲 刘敏 尹国宇 高娟 刘程
• 机 构: 华东师范大学河口海岸学国家重点实验室,华东师范大学地理信息科学教育部重点实验室,华东师范大学地理科学学院
• 出 处: 华东师范大学学报(自然科学版)
• 发表日期: 2019年3期
• 关键词: 硝化微生物 富集培养 潮滩沉积物 种群丰度 基因表达
• 基金项目: 国家重点研发计划课题(2016YFA0600904);国家自然科学基金(41725002,41671463,41130525,41322002,41601530)

对采集的长江口潮滩沉积物进行了硝化微生物的富集培养,通过宏基因组技术分析了富集物中硝化微生物的种群结构.检测到4类硝化微生物(占测序总reads的34.7%),包括新近发现的全程氨氧化微生物(complete ammonia oxidizers,comammox)、严格的亚硝酸盐氧化菌Nitrospira、β-变形菌门氨氧化细菌及氨氧化古菌.其中,comammox占硝化微生物类群的48%.此外,基于宏转录组技术分析了4类硝化菌群的基因表达特征(依据Evolutionary genealogy of gen