【摘 要】
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基于网络药理学分析绿茶中的主要多酚物质表没食子儿茶素没食子酸酯(Epigallocatechin Gallate,EGCG)对三阴性乳腺癌细胞MDA-MB-231的潜在作用靶点及其分子机理.使用数据库检索EGCG和MDA-MB-231的潜在靶点,两者的靶点基因相互映射取交集,获得共同作用靶点;借助软件Cytoscape 3.8.0绘制“靶点-通路”网络互作图、String数据库构建靶点蛋白的互作网络关系(Protein-Protein Interaction,PPI),基于Metascape平台对靶点进行
【机 构】
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华东理工大学生物工程学院,生物反应器工程国家重点实验室,上海 200237;三生国健药业(上海)股份有限公司研发中心,上海 201203
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基于网络药理学分析绿茶中的主要多酚物质表没食子儿茶素没食子酸酯(Epigallocatechin Gallate,EGCG)对三阴性乳腺癌细胞MDA-MB-231的潜在作用靶点及其分子机理.使用数据库检索EGCG和MDA-MB-231的潜在靶点,两者的靶点基因相互映射取交集,获得共同作用靶点;借助软件Cytoscape 3.8.0绘制“靶点-通路”网络互作图、String数据库构建靶点蛋白的互作网络关系(Protein-Protein Interaction,PPI),基于Metascape平台对靶点进行基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析;通过分子对接和体外实验验证预测结果.结果表明:通过挖掘,共获得EGCG靶点537个,MDA-MB-231靶点181个,取交集获得88个共同潜在靶点,进一步筛选保留30个核心作用靶点;获得20条核心GO生物进程和17条KEGG信号通路,涉及到癌症信号通路,毒性耐受通路,胰腺癌通路、直肠癌通路,小细胞肺癌通路等;分子对接结果显示,EGCG可以通过非共价键与β-连环蛋白(β-catenin)结合;体外实验表明,肝细胞生长因子(Hepatocyte Growth Factor,HGF)能够诱导 β-catenin的表达,而EGCG能够抑制HGF诱导的β-catenin的表达上调.EGCG可以通过多靶点、多途径干预MDA-MB-231,已经初步证实EGCG可以影响HGF/β-catenin途径.
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