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本文基于多巴胺与其第三受体复合蛋白(D3R)结构,采用分子动力学技术Gromacs4.5程序中的伞形样本方法,研究多巴胺在多巴胺第三受体蛋白结构中的运动轨迹及其过程中自由能变化,探讨多巴胺在其分子通道上传输运动机制动力学。分子模拟表明,处在发挥神经递质作用部位的多巴胺,通过D3R结构中的功能分子通道沿着旷轴朝细胞外方向传输运动的自由能变化数值为134.6kJ·mol^-1,沿着y-轴朝细胞内传输运动的自由能变化为211.5kJ·mol^-1。在D3R结构中,多巴胺沿着x+、x-、z+、