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新农合和城镇居民医保无论是个人缴费还是各级财政的补助资金，都远低于城镇职工医保的年人均筹资标准，尽管两项基金的筹资标准逐年提高，但随着医疗技术的飞速发展、参保群众医疗消费需求的不断增长等因素影响，基金收入的增长幅度远远落后于基金支出的增长幅度，基金面临巨大的赤字风险。因此，既要根据筹资标准、筹资总额水平，也要结合各地的住院率，医疗消费水平等指标，还要考虑到统筹基金占医疗费支出总量的比例，科学合理地设定待遇水平。