野生铁皮石斛rDNA ITS序列分析

• 作 者: 李海霞 黄海波 刘鹏 黄松 张桂芳 张丹雁 张建霞 陈念 赖
• 机 构: 广州中医药大学中药学院,中国科学院华南植物园
• 出 处: 世界科学技术：中医药现代化
• 发表日期: 2012年5期
• 关键词: 铁皮石斛 内转录间隔区 系统发育分析 物种鉴定 Dendrobium officinale ITS phylogenetic analysis speci
• 基金项目: 科学技术部国家“十二五”科技支撑计划项目（2011BA101B02）：珍稀中药材铁皮石斛GAP基地优化升级及开发利用研究,负责人：赖小平,国家自然科学基金项目（81001601）：特异性DNA探针和特征肽指纹图谱技术在燕窝质量评价中的应用,负责人：赖小平,广东省自然科学基金博士启动项目（10451040701006101）：基于DNA条形码技术的蛇蜕药材来源物种鉴定研究,负责人：陈念.致谢：感谢中

目的：测定和分析不同产地野生铁皮石斛样品的rDNA ITS序列，探讨利用ITS序列推测铁皮石斛样品产地来源的可行性。方法：提取总基因组DNA，使用通用引物ITS5F／ITS4R进行PCR扩增，产物经电泳检测、纯化和测序后用Sequin 11．0提交GenBank。用Bioedit 7．0中的Clustal W对GenBank中包括本研究提交的11条在内的所有33条铁皮石斛的ITS序列进行多重序列比对，随后以金钗石斛和密花石豆兰为外群，用邻接法构建NJ系统发育树。结果：从所有测定的ITS序列中选择11条提交