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洞庭湖是我国第二大淡水湖，是长江最重要的调蓄湖泊，而三峡工程和洞庭湖息息相关的水系联系，使得三峡工程对洞庭湖的影响非常巨大。一方面是洞庭湖泥沙淤积量的大量减少，这是对洞庭湖的维持非常有利的，另一方面是水量减少水体自净能力降低，部分湖区、内河的富营养化和干涸现象十分普遍，水环境容量下降，给洞庭湖区的饮水安全和水生态环境构成严重威胁。