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目的：分析本院新生儿非细菌性病原感染现状，了解非细菌性病原体的种类及感染特点。方法2012年2月~2013年2月本科收治的79例感染非细菌性病原的新生儿，对其临床诊断和治疗进行回顾性分析。结果新生儿非细菌性病原感染以流感病毒、巨细胞病毒、支原体、衣原体、乙肝病毒、呼吸道合胞病毒、腺病毒、EB病毒、轮状病毒、HIV为常见病原体。临床表现不一。结论新生儿非细菌病原感染比临床表现不一，加强新生儿的非细菌病原感染的检测非常必要。非细菌性病原体在新生儿感染中占重要地位，病原学诊断对指导临床治疗有重要价值。