深度测序鉴定绵羊microRNA转录组

• 作 者: 张世芳 魏彩虹 陆健 张小宁 周鑫磊 张淑珍 王光凯 曹家雪
• 机 构: 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
• 出 处: 中国畜牧兽医
• 发表日期: 2013年9期
• 关键词: Solexa测序 Texel绵羊 背最长肌 microRNA转录组 Solexa sequencing Texel sheep longissimus
• 基金项目: “十二五”863项目“绵羊全基因组关联分析研究”（2011AA100307-02）,国家自然科学基金（30972094）.

本研究采集的Texel绵羊胎儿的背最长肌样品包括5个发育阶段：70、85、100、120和135 d。通过采用Solexa测序技术对混池样品进行了microRNA（miRNA）深度测序,获得了16532850条原始序列读数。使用ACGT101-miR v4.2分析软件对miRNA测序数据进行了深度发掘;通过与最新的哺乳动物成熟miRNA序列（miRNA数据库：miRBase v17.0）、miRNA前体序列、绵羊基因组序列（绵羊基因组数据库,2010年2月）的比对分析,对绵羊microRNA转录组数据库进