Cloning and Characterization of Gene cab-PhE4 in Phyllostachys edulis

来源 :Chinese Forestry Science and Technology | 被引量 : 0次 | 上传用户:lxw19831201
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A fragment with about 798 bp of cab gene was amplified from the first strand of Moso(Phyllostachys edulis)cDNA through RT-PCR method,named as cab-PhE4(cab gene 4 from Ph.edulis).The cab-PhE4(GenBank accession number:EF405878)gene encodes 265 amino acid.The bioinformatics analysis indicated that the protein encoded by cab-PhE4 has a chlorophyll a/b-binding domain(64th-232nd position),a protein kinase C phosphorylation site(33rd-35th position),a N-myristoylation site(169th-174th position),and an involucrin repeat(207th-216th position).The amino acid sequence of cab-PhE4 showed high similarity with the cab genes of Zea mays,Triticum aestivum,Musa acuminata,Panax ginseng and Oryza sativa,more than 90%,respectively. A fragment with about 798 bp of cab gene was amplified from the first strand of Moso (Phyllostachys edulis) cDNA by RT-PCR method, named as cab-PhE4 (cab gene 4 from Ph.edulis). The cab-PhE4 (GenBank accession number: EF405878) gene encodes 265 amino acid.The bioinformatics analysis indicated that the protein encoded by cab-PhE4 has a chlorophyll a / b-binding domain (64th-232nd position), a protein kinase C phosphorylation site (33rd-35th position) the amino acid sequence of cab-PhE4 showed high similarity with the cab genes of Zea mays, Triticum aestivum, Musa acuminata, Panax ginseng and Oryza sativa, more than 90%, respectively.
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