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中药材的真伪对于中医临床用药具有至关重要的作用。作为中药鉴定的重要组成部分，分子标记技术的应用已越来越泛在，具重要的中药材真伪鉴别意义。本文以药材金银花真伪鉴别为例，介绍了ITS 序列测序技术、叶绿体基因区段测序技术、RAPD 分析技术、ISSR 分子标记技术等金银花药材鉴定中应用最广的分子标记技术。以期筛选到适合金银花快速真伪鉴别的方法，也为其他中药材分子鉴别研究提供示范。