冠心病与生物钟关联靶基因的生物信息学挖掘

• 作 者: 王文栋 苏翰博 樊茜茜 李喜龙 常晓彤
• 机 构: 河北北方学院医学检验学院
• 出 处: 医学研究与教育
• 发表日期: 2020年5期
• 关键词: 生物钟 冠心病 生物信息学 染色体定位 富集分析 biological clockcoronary heart diseasebioinformaticschr
• 基金项目: 河北省高等学校科学技术研究项目(Z018032),河北省卫生计生委医学科学研究课题计划项目(20180811),河北省高等学校科学技术研究重点项目(ZD2018076),河北北方学院创新人才培育项目(CXRC1316),河北北方学院大学生创新创业训练计划项目(xj201945)

目的分析生物节律紊乱与冠心病发生关联的潜在分子机制。方法从GEO数据库中获取GSE71226芯片数据,用R软件筛选冠心病差异表达基因;经文本挖掘和蛋白互作分析获得生物钟相关基因,进行功能注释、染色体定位和互作分析。结果获得488个冠心病差异表达基因(coronary heart disease differentially expressed genes,CHD-DEGs)和64个生物钟相关基因(biological clock related genes,BRGs),在染色体上分布密集,且多与转录调控、