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目的采用比较蛋白质组学方法研究高原鼠兔和Wistar大鼠线粒体蛋白的差异。方法分别在海拔4500m高原（高原鼠兔）和模拟4500m低压舱内麻醉动物后取双侧腓肠肌，分离纯化线粒体蛋白进行二维电泳和凝胶图像分析，对差异蛋白质用MALDI-TOF-MS质谱仪进行肽指纹图谱测定和ESI-Q-TOF串联质谱鉴定。结果高原鼠兔和Wistar大鼠线粒体蛋白二维凝胶图谱有明显差异；鉴定了泛醌-细胞色素C还原酶核心蛋白I、硫氧还原蛋白依赖性过氧化物还原酶线粒体前体蛋白、线粒体胸苷激酶2、肌酸激酶线粒体异构体4、推测蛋白XP