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分子结构的结构熵被定义为Ｅ＝ｌｎＮ（Ｎ－１）（Ｎ０２）／２Ｖ，其中Ｎ是总原子数，Ｖ＝П↓ｉ↑ｍｍａｘ（ｌｉ），ｍａｘ（ｌｉ）表示分子所在空间中ｉ方向分量的２原子间最大距离。分子结构的关联维数由Ｄｑ＝ｌｉｍ↓ε→０ｌｏｇＣｑ（ε）／ｌｏｇε，其中Ｃｑ（ε）表示ｑ阶关联积分。从蛋白质数据库选出３０个蛋白质，根据上述定义计算它们的Ｅ和Ｄ２值，结果发现，结构熵随着原子数的增加而减少。因此，对于描述分子结构