【摘 要】
：
目的通过对与黑色素瘤转移相关的基因芯片进行生物信息学分析,为探索黑色素瘤转移的分子机制提供理论依据。方法从公共基因数据库(GEO)中下载与黑色素瘤转移相关的基因芯片数
论文部分内容阅读
目的通过对与黑色素瘤转移相关的基因芯片进行生物信息学分析,为探索黑色素瘤转移的分子机制提供理论依据。方法从公共基因数据库(GEO)中下载与黑色素瘤转移相关的基因芯片数据,经数据预处理后,分别通过BRB-Array Tools软件、DAVID在线分析软件、STRING在线数据库和Cytoscape软件进行差异表达基因的筛选、功能注释、通路分析、蛋白互作网络分析并计算网络及各个节点的拓扑特性。结果 BRB分析筛选出196个黑色素瘤转移差异表达基因,其中上调133个,下调36个,DAVID分析发现其主要集中在角质形成细胞分化、组织细胞间黏附、肥大细胞分化等生物学过程和Rap1信号通路、p53信号通路、谷胱甘肽代谢等通路。STRING分析发现了蛋白质网络互作图中的9个关键基因,分别为KRT14、KRT16、KRT1、EGFR、KIT、DSP、DSG1、PKP1、KLK7。结论通过生物信息学的方法对黑色素瘤转移相关基因芯片数据进行2次挖掘,为进一步研究黑色素瘤转移的相关机制提供了理论依据。
其他文献
目的调查深低温冻存脐血输注不良反应的发生情况，明确主要不良反应的影响因素。探讨深低温冻存脐血复温后体外保存时间对造血干细胞活性的影响，寻求深低温冻存脐血的最佳输注时
分布式数据处理技术在诸多企业的生产中已经得到了广泛的应用，数字视频监控系统在分布式数据处理技术的基础上，采用先进的网络技术、多媒体技术和通信技术，实现了实时视频数据的
叉子圆柏在当今生态园林建设中越来越受到重视.近年来在生产上应用较广,但有关文字介绍颇少.本文就其生理特点、生态效应、园林应用及经济前景进行详细介绍,旨在推动其在生态
社区矫正服务是职务犯罪人员犯罪后回归社会所享有的第一种服务,也是在矫期间最基本最重要的社会服务。社区矫正服务是否完善和充分,对职务犯罪人员身心健康有很重要的影响,
目的：耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(Methicillin-resistant staphylococcus aureus, MRSA)是临床常见的病原菌，治疗棘手，死亡率高，已成为严重的临床医学及公共卫生问题。自1961年首
目的：医务人员工作满意度水平与患者满意度高低息息相关,本研究通过调研了解深圳市医务人员满意度现状及影响因素,为提高医务人员满意度水平提供理论依据,为医院管理部门制定
给出分离自伴边界条件与耦合自伴边界条件之间的关系。
本文综述了基于信源信道思想,及其在蒙古语与汉语统计机器翻译中的应用.基于统计的方法是语言信息处理及机器翻译领域的研究热点.本文介绍了1个蒙古语与汉语基于统计的机器翻