O157∶H7型大肠埃希菌CRISPR/Cas系统结构的生物信息学分析

• 作 者: 王鹏飞 王颖芳 段广才 詹煜慧 陈帅印 郗园林 徐亚珂
• 机 构: 河南科技大学医院,河南科技大学医学院,郑州大学公共卫生学院
• 出 处: 中国畜牧兽医
• 发表日期: 2020年2期
• 关键词: O157∶H7型大肠埃希菌 CRISPR CAS Escherichia coli O157∶H7CRISPRcas
• 基金项目: 国家科技部重大专项资助课题(2013ZX10004607、2018ZX10301407)

为了解O157∶H7型大肠埃希菌中成簇的规律间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)分布和结构特征及cas基因分布情况,本试验通过GenBank数据库和CRISPRdb database获得92株O157∶H7型大肠埃希菌全基因组序列、CRISPR位点位置、CRISPR的侧翼序列及cas基因簇的序列范围,利用多序列比对、启动子预测和RNA二级结构预测等方法分析细菌中CRISPR系统的特点。结果显示