杜梨NHX基因家族的鉴定及其在非生物胁迫下的表达分析

• 作 者: 王影 李慧 蔺经 杨青松 张绍铃 常有宏
• 机 构: 南京农业大学园艺学院,江苏省农业科学院果树研究所,江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室
• 出 处: 果树学报
• 发表日期: 2019年7期
• 关键词: 杜梨 NHX基因家族 非生物胁迫 实时定量PCR
• 基金项目: 国家自然科学基金(31372051,31772287);江苏省自然科学基金(BK20151361)

[目的]NHX基因亚家族为钠氢逆转运体,具有Na^+/H^+ exchange(PF00999)蛋白结构域,广泛存在于多种物种中,主要参与植物响应盐胁迫过程离子平衡的重建。分析鉴定杜梨中NHX基因及其耐盐机制有助于实际生产中更为有效地利用这一砧木资源。[方法]结合已公布的梨基因组数据以及拟南芥相关数据,通过生物信息学手段,鉴定杜梨NHX基因家族成员;通过MEGA7.0软件进行序列比对以及进化分析;通过在线工具Pfam、SMART以及GSDS进行基因结构分析;通过定量PCR技术分析非生物胁迫下基因在不同组织