【摘 要】
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为探明绿壳蛋鸡LSm14A分子序列特征与其在绿壳蛋鸡体内不同组织中的分布情况。本研究利用RT-PCR方法扩增LSm14A基因编码区全长序列并进行克隆测序。利用DNAStar软件对LSm14A
【机 构】
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贵州大学动物科学学院; 贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室;
【基金项目】
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国家自然科学基金(No.31460668);贵州省科学技术基金(No.(2015)2046);贵州大学博士基金(No.(2013)12)、贵州大学研究生创新基金(No.研农2015024)、贵州大学“本科教学工程”项目(No.JKSP2013004);贵州省科技创新人才团队项目[No.黔科合人才团队(2015)4016]共同资助
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为探明绿壳蛋鸡LSm14A分子序列特征与其在绿壳蛋鸡体内不同组织中的分布情况。本研究利用RT-PCR方法扩增LSm14A基因编码区全长序列并进行克隆测序。利用DNAStar软件对LSm14A基因与鸭、人、鼠等其他13个物种的LSm14A基因核苷酸、氨基酸序列进行比对分析,并对绿壳蛋鸡LSm14A基因所编码的蛋白进行了二级结构、B细胞表位、保守结构域、跨膜结构域和信号肤预测。同时采用实时荧光定量PCR方法检测绿壳蛋鸡源LSm14A基因在绿壳蛋鸡不同组织中的转录水平差异。绿壳蛋鸡LSm14A基因克隆结果显示:绿壳蛋鸡LSm14A全长CDS为1386 by,编码461个氨基酸;与原鸡源LSm14A相似性达99.6%,与鸭源的LSm14A相似性为94.7%,与人源、猴源、猪源、爪蟾的LSm14A相似性较低;系统进化树显示其序列与原鸡的亲缘关系最近,且处于同一遗传进化分枝。绿壳蛋鸡LSm14A基因编码蛋白结构预测结果显示:绿壳蛋鸡LSm14A基因编码蛋白亲水性较好,为非分泌蛋白,含有Sm1与Sm2基序和FDF结构域,不存在跨膜结构,荧光定量结果显示:LSm14A分子在绿壳蛋鸡不同组织中均有分布且有不同程度的表达,在免疫器官法氏囊、胸腺中表达较高,而在肝脏中表达最低。本研究结果说明绿壳蛋鸡LSm14A分子具有较高的保守性,在绿壳蛋鸡不同组织中呈广泛性表达,在禽类中枢免疫器官中呈高水平表达,将为研究LSm14A分子在天然免疫中的作用机制、防控禽类病毒性疾病奠定基础。
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