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目的：探讨内镜下潜行切除闭锁式引流术治疗高位肛瘘的临床效果。方法：2013-2015年我院收治的60例高位肛瘘患者，随机分为观察组与对照组，每组30例，观察组采用内镜下潜行切除闭锁式引流术进行治疗，对照组采用切开挂线术进行治疗，观察两组患者的临床效果。结果：观察组与对照组在手术总有效率方面无明显差异（P>0.05）；但观察组手术创面愈合时间、疼痛指数、Wexner评分等指标与对照组之间存在统计学差异（P<0.01）。结论：内镜下潜行切除闭锁式引流术治疗高位肛瘘具有术后愈合快、疼痛轻、保护肛门功能等优势，具有较好的临床推广应用价值。