HOXD10甲基化水平与表达水平的关联及其对肺腺癌预后的影响

• 作 者: 吴稚晖 袁悉奥 李慧源 龚强 彭千 吴秋 李文灿
• 机 构: 株洲市中心医院心胸外科,长沙金域医学检验实验室有限公司
• 出 处: 临床与病理杂志
• 发表日期: 2020年11期
• 关键词: 肺腺癌 HOXD10 甲基化 预后 lung adenocarcinomaHOXD10methylationprognosis
• 基金项目: 湖南省自然科学基金(2017JJ4072)

目的:分析HOXD10基因启动子区甲基化水平与基因表达水平的关联并探索HOXD10与肺腺癌临床病理特征和预后的关系。方法:采用R语言拓展包TCGAbiolinks进行基因差异表达分析和差异甲基化分析,利用肿瘤基因组计划(The Cancer Genome Atlas,TCGA)项目肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)数据集中521例癌症组织和58例癌旁组织的RNA-seq数据分析HOXD10基因差异表达,利用同一数据集中461例癌症组织和32例癌旁组织的甲基化芯片数据分析HOXD10