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摘要 动物系谱档案是记录动物系谱及其基本信息的一份基本资料,在生产工作中有识别个体差异、避免近亲繁殖、分析遗传多样性等积极作用。主要介绍了构建动物的个体系谱档案的具体步骤,并分析和总结在大型规模化养殖过程中进行系谱构建的重要意义和作用,同时简单介绍了新型的微卫星DNA分子系谱技术。
关键词 规模化养殖;动物系谱;档案构建;步骤;意义
中图分类号 S814 文献标识码 A 文章编号 1007-5739(2016)01-0291-02
动物系谱是记录动物本身及其父母、2~3代祖先情况的一份资料。完整的动物系谱一般应该包括个体的2~3代祖先的编号、名称及生产成绩等情况。它是动物遗传育种信息的主要来源,能用于识别个体、制定配种计划、确定动物间血缘关系及畜牧场内近交率,以及估计动物种群遗传参数等。
在生产中,根据动物系谱确定血缘关系、选留种畜,对品种改良、保种选育、制定发展规划等有重要应用意义。同时,给畜牧种场内动物建立完整的系谱档案,能保证交配、繁殖档案记录清晰,避免近亲繁殖。尤其是以个体选择为主的现代育种实践,必须明确个体间的亲缘关系,否则将会导致群体的近交退化和遗传多样性的丢失。
1 系谱档案的构建
以本场内所有现存本品种动物为基础建立系谱档案,系谱档案包括个体号、出生日期、来源、谱系、生长发育记录、繁殖记录、生产记录等。一般系谱档案可分为卡片式个体系谱和电子档案系谱2种形式。在很多遗传育种方面书籍中都有详细介绍。现以实践中经验,介绍构建方法如下。
1.1 编号
编号原则上实行一个动物一个编号,终生使用。编号应该包含信息全面、方法简单、容易管理和识别。并且确定长时间内不会出现重号,以保证个体信息的唯一准确性。
一般根据畜牧场内情况进行編号,采用英文字母和多位数字组成,例如第1、2位为畜牧养殖场拼音的首个字母;第3、4位为动物品系编号;第5、6位为出生年度末2位数;第7、8、9位则为动物出生序号。则广西畜牧场内品系为01的2015年出生的第1只动物可编号为GX0115001(表1)。
1.2 个体系谱卡
对编好号的个体进行个体系谱卡的制定。个体系谱卡中包括养殖场名称、个体编号、个体资料、2~3代系谱(亲代、祖亲代和曾祖亲代的个体号),父亲的带有育种值资料,母亲的应有繁殖和生产记录资料(表2)。
1.3 数据记录
一般应该设专人进行系谱档案的记录和保管。对所有数据进行认真查对、补全,要及时构建新生动物的个体系谱。在记录系谱卡的同时,注意电子档案的录入和进行备份。保持数据的不断更新完善和真实可靠性,才能更好地为生产工作服务。
1.4 配套疾病及用药档案记录
在构建个体系谱卡的同时,配套进行动物疾病和用药档案记录,让人们更清晰地了解动物个体情况,及时了解和发现动物有无重大疾病、抗药性等。在生产实践中,不论是繁殖、兽医等技术人员,还是客户都能通过个体系谱卡较好地了解动物。
2 建立系谱档案的意义
在现代化的大型规模养殖场中,由于规模大、留放动物多、引种次数多等原因,动物总体数量多且品系较杂乱。因此,不论是为了便于管理统计,还是提高畜禽质量和引进新种畜、选育优良品种,都必须根据动物系谱和个体生长情况进行考虑。技术人员充分了解本场动物系谱及品种情况,才能更好完成工作。
2.1 快速准确识别个体,有效防范近亲繁殖
对养殖场内每个动物采用唯一的编号,构建动物的个体系谱档案,根据编号给动物打上耳标,能有效快速地让技术人员和饲养员对动物个体进行鉴别。在饲养繁殖过程中,快速识别动物能更好地观察动物,发现动物异常情况。同时,在个体选育为主的育种工作中,可快速可靠地排查近亲动物,避免近亲繁殖交配等。
2.2 血缘清晰,有利于品种改良和遗传选育
在规范化养殖场中,引进和调出种畜禽都要求具备动物的系谱,以进行亲权鉴定。注重于畜禽的血缘关系,避免近亲繁殖,提高动物的繁殖性能。特别是在品种改良和新品种开发等科研工作中,都要求有动物系谱,分清动物个体血缘关系和动物遗传多样性等。
2.3 查阅档案,定位发展方向并制定发展规划
规模化的大型养殖场,每年都要制定具体的发展规划,以应对新形势发展的需要。而搞好动物的系谱建设,将在评估动物的品系、生产性能和繁殖性能等方面提供帮助。有了完善的动物系谱档案,可以让人们清楚地了解自己养殖的动物。
2.4 研究遗传多样性,改育新品种
构建动物系谱,将会是研究动物的个体差异、遗传差异的基本需要。随着社会不断发展,人民需求也相应提高,养殖场必须研究发展更好的畜禽品种以满足人民生活需要。大型规模化养殖场不再局限于养殖现有品种动物,而着眼于培养自己特色产品。而科研改良必须从现有的动物中进行遗传分析和杂交选育,研究其遗传特性才能更好地进行品种改良和培育新品种的工作。
3 新一代的系谱记录方法——微卫星DNA标记构建分子系谱
现有的系谱档案多为纸质的人工记录,或是录入电脑中保存的简单记录档案。往往存在完全或部分丢失、信息记录不完全、涵盖世代较少以及个人书写记录错误率高(占3%~20%)等问题;而新一代的利用遗传模式明确的DNA分子标记构建的分子系谱,既可通过多级别的亲权鉴定验证或完善原有系谱信息,也可对其群体内、家系间或个体间的遗传关系进行评估,有助于对所研究群体实施更为全面的遗传管理[1]。
微卫星(micro satellite)技术又称为简单重复序列(simple sequence repeats,SSR),是第2代的分子遗传标记,大量随机分布于真核生物的基因组内,具备有多态性丰富、呈共显性遗传、检测方便等特点,是绘制动物遗传图谱和研究近缘物种间遗传关系的理想标记[2-3]。目前,微卫星技术被广泛应用于动物的亲权鉴定研究,其原理是根据微卫星位点的共显性遗传规律,通过计算机排除概率来进行亲代个体间的亲缘关系鉴定。在科研中,微卫星标记进行亲权鉴定主要用于大熊猫、东北虎、中国对虾、绵羊、山羊、奶牛、猪等动物开展遗传育种方面的相关研究。
近几年来,微卫星技术在生产中得到广泛应用。主要是以系谱完善的动物群体为研究对象,通过多级亲权鉴定方法构建多代次分子系谱,验证原有系谱记录的准确性,并进一步分析所构建畜禽品系的遗传特征及品种改良情况。微卫星DNA分子系谱优化了家养动物分子系谱的构建条件,能较好评估群体内不同品系的遗传特征等[4]。
4 参考文献
[1] 纪志宾,王桂芝,王金凤,等.崂山奶山羊分子系谱的构建及家系遗传特征分析[J].中国农业科学,2011,44(13):2796-2807.
[2] 王月月,刘雪雪,董坤哲,等.7种家养动物全基因组微卫星分布的差异研究[J].中国畜牧兽医,2015,42(9):2418-2426.
[3] 刘玮孟,张静,卢立志,等.微卫星标记及其在家畜育种中的应用[J].浙江农业学报,2008,20(6):496-500.
[4] 张琼,刘小林,李喜莲,等.EST-SSR分子标记在水生动物遗传研究中的应用[J].水产科学,2010,29(5):302-306.
关键词 规模化养殖;动物系谱;档案构建;步骤;意义
中图分类号 S814 文献标识码 A 文章编号 1007-5739(2016)01-0291-02
动物系谱是记录动物本身及其父母、2~3代祖先情况的一份资料。完整的动物系谱一般应该包括个体的2~3代祖先的编号、名称及生产成绩等情况。它是动物遗传育种信息的主要来源,能用于识别个体、制定配种计划、确定动物间血缘关系及畜牧场内近交率,以及估计动物种群遗传参数等。
在生产中,根据动物系谱确定血缘关系、选留种畜,对品种改良、保种选育、制定发展规划等有重要应用意义。同时,给畜牧种场内动物建立完整的系谱档案,能保证交配、繁殖档案记录清晰,避免近亲繁殖。尤其是以个体选择为主的现代育种实践,必须明确个体间的亲缘关系,否则将会导致群体的近交退化和遗传多样性的丢失。
1 系谱档案的构建
以本场内所有现存本品种动物为基础建立系谱档案,系谱档案包括个体号、出生日期、来源、谱系、生长发育记录、繁殖记录、生产记录等。一般系谱档案可分为卡片式个体系谱和电子档案系谱2种形式。在很多遗传育种方面书籍中都有详细介绍。现以实践中经验,介绍构建方法如下。
1.1 编号
编号原则上实行一个动物一个编号,终生使用。编号应该包含信息全面、方法简单、容易管理和识别。并且确定长时间内不会出现重号,以保证个体信息的唯一准确性。
一般根据畜牧场内情况进行編号,采用英文字母和多位数字组成,例如第1、2位为畜牧养殖场拼音的首个字母;第3、4位为动物品系编号;第5、6位为出生年度末2位数;第7、8、9位则为动物出生序号。则广西畜牧场内品系为01的2015年出生的第1只动物可编号为GX0115001(表1)。
1.2 个体系谱卡
对编好号的个体进行个体系谱卡的制定。个体系谱卡中包括养殖场名称、个体编号、个体资料、2~3代系谱(亲代、祖亲代和曾祖亲代的个体号),父亲的带有育种值资料,母亲的应有繁殖和生产记录资料(表2)。
1.3 数据记录
一般应该设专人进行系谱档案的记录和保管。对所有数据进行认真查对、补全,要及时构建新生动物的个体系谱。在记录系谱卡的同时,注意电子档案的录入和进行备份。保持数据的不断更新完善和真实可靠性,才能更好地为生产工作服务。
1.4 配套疾病及用药档案记录
在构建个体系谱卡的同时,配套进行动物疾病和用药档案记录,让人们更清晰地了解动物个体情况,及时了解和发现动物有无重大疾病、抗药性等。在生产实践中,不论是繁殖、兽医等技术人员,还是客户都能通过个体系谱卡较好地了解动物。
2 建立系谱档案的意义
在现代化的大型规模养殖场中,由于规模大、留放动物多、引种次数多等原因,动物总体数量多且品系较杂乱。因此,不论是为了便于管理统计,还是提高畜禽质量和引进新种畜、选育优良品种,都必须根据动物系谱和个体生长情况进行考虑。技术人员充分了解本场动物系谱及品种情况,才能更好完成工作。
2.1 快速准确识别个体,有效防范近亲繁殖
对养殖场内每个动物采用唯一的编号,构建动物的个体系谱档案,根据编号给动物打上耳标,能有效快速地让技术人员和饲养员对动物个体进行鉴别。在饲养繁殖过程中,快速识别动物能更好地观察动物,发现动物异常情况。同时,在个体选育为主的育种工作中,可快速可靠地排查近亲动物,避免近亲繁殖交配等。
2.2 血缘清晰,有利于品种改良和遗传选育
在规范化养殖场中,引进和调出种畜禽都要求具备动物的系谱,以进行亲权鉴定。注重于畜禽的血缘关系,避免近亲繁殖,提高动物的繁殖性能。特别是在品种改良和新品种开发等科研工作中,都要求有动物系谱,分清动物个体血缘关系和动物遗传多样性等。
2.3 查阅档案,定位发展方向并制定发展规划
规模化的大型养殖场,每年都要制定具体的发展规划,以应对新形势发展的需要。而搞好动物的系谱建设,将在评估动物的品系、生产性能和繁殖性能等方面提供帮助。有了完善的动物系谱档案,可以让人们清楚地了解自己养殖的动物。
2.4 研究遗传多样性,改育新品种
构建动物系谱,将会是研究动物的个体差异、遗传差异的基本需要。随着社会不断发展,人民需求也相应提高,养殖场必须研究发展更好的畜禽品种以满足人民生活需要。大型规模化养殖场不再局限于养殖现有品种动物,而着眼于培养自己特色产品。而科研改良必须从现有的动物中进行遗传分析和杂交选育,研究其遗传特性才能更好地进行品种改良和培育新品种的工作。
3 新一代的系谱记录方法——微卫星DNA标记构建分子系谱
现有的系谱档案多为纸质的人工记录,或是录入电脑中保存的简单记录档案。往往存在完全或部分丢失、信息记录不完全、涵盖世代较少以及个人书写记录错误率高(占3%~20%)等问题;而新一代的利用遗传模式明确的DNA分子标记构建的分子系谱,既可通过多级别的亲权鉴定验证或完善原有系谱信息,也可对其群体内、家系间或个体间的遗传关系进行评估,有助于对所研究群体实施更为全面的遗传管理[1]。
微卫星(micro satellite)技术又称为简单重复序列(simple sequence repeats,SSR),是第2代的分子遗传标记,大量随机分布于真核生物的基因组内,具备有多态性丰富、呈共显性遗传、检测方便等特点,是绘制动物遗传图谱和研究近缘物种间遗传关系的理想标记[2-3]。目前,微卫星技术被广泛应用于动物的亲权鉴定研究,其原理是根据微卫星位点的共显性遗传规律,通过计算机排除概率来进行亲代个体间的亲缘关系鉴定。在科研中,微卫星标记进行亲权鉴定主要用于大熊猫、东北虎、中国对虾、绵羊、山羊、奶牛、猪等动物开展遗传育种方面的相关研究。
近几年来,微卫星技术在生产中得到广泛应用。主要是以系谱完善的动物群体为研究对象,通过多级亲权鉴定方法构建多代次分子系谱,验证原有系谱记录的准确性,并进一步分析所构建畜禽品系的遗传特征及品种改良情况。微卫星DNA分子系谱优化了家养动物分子系谱的构建条件,能较好评估群体内不同品系的遗传特征等[4]。
4 参考文献
[1] 纪志宾,王桂芝,王金凤,等.崂山奶山羊分子系谱的构建及家系遗传特征分析[J].中国农业科学,2011,44(13):2796-2807.
[2] 王月月,刘雪雪,董坤哲,等.7种家养动物全基因组微卫星分布的差异研究[J].中国畜牧兽医,2015,42(9):2418-2426.
[3] 刘玮孟,张静,卢立志,等.微卫星标记及其在家畜育种中的应用[J].浙江农业学报,2008,20(6):496-500.
[4] 张琼,刘小林,李喜莲,等.EST-SSR分子标记在水生动物遗传研究中的应用[J].水产科学,2010,29(5):302-306.