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对国内外主要应用的6种微卫星开发技术直接文库筛选法、基于锚定PCR技术法、单引物延伸富集法、选择杂交富集法、生物信息学法、转移扩增法进行了综合评价。在结合自己的研究经历及近几年相关的文献报道的基础上，发现目前选择杂交富集法从技术难度、开发效率、开发微卫星的多态性水平3方面综合评价为最有效的微卫星开发技术；传统的直接文库筛选法由于工作量巨大目前报道较少；随着生物数据库核酸序列的不断增加，生物信息学法将会发展成为一种经济、快速、高效的微卫星开发技术；而锚定PCR技术则适合于微卫星文库的筛选，该法可以有效淘汰侧