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外生菌根真菌可与很多高等植物共生，广泛存在于自然界，在促进植物生长和养分吸收、增强宿主抗逆性及维持森林生态系统稳定等方面发挥着重要作用。除与寄主植物密切联系外，外生菌根真菌与细菌也常常形成共生关系，并在其生命周期中与细菌群落进行物理和代谢相互作用。这些细菌对外生菌根真菌菌丝生长、生物量增加及子实体的形成具有积极影响。本文阐述了外生菌根真菌与内生细菌共生现象的发现、共生关系的建立、内生细菌促进外生菌根真菌生长和发育以及宿主与微生物组的研究方法等，以期更好地巩固外生菌根真菌的生物学及生态学等基础性知识，并利用细菌与真菌的相互作用为可食用外生菌根真菌的生物防治、菌肥研究、人工驯化及栽培提供思路。