酶—配体复合物亲和性的计算

来源 :物理化学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ifever2006
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
描述了一种新的计算酶-配体复合物亲和性的方法,它考虑了酶-配体结合过程中自由能变化的各主要因素,并利用经验公式加以计算,从蛋白质结构数数据库中选取了66个酶-配体复合物作为训练集,利用回归分析得出了后的模型,此模型通用于各种类型的酶-配体复合物,计算结果比较准确,预测复合物解离常数的平均偏差小于一个数量级,此方法还可以定量评价配体分子每个部分对结合过程的贡献大小,可以为先导化合物的估化提供非常直接
其他文献
用半经验分子轨道理论方法(AM1方法)对一系列具有不同取代基的水杨醛类席夫碱的变色机理进行了研究。发现此类席夫碱的变色过程分为两步,有色产物主要为醌式结构。
研究了贮氢合金两种表面化学处理方法对MH电极活化性能及Ni/MH电池1C义放电 影响;第一种处理方法是贮氢合金在6mol/L^-1KOH溶液中80℃处理8h,第二种处理方法是在含有0.04mol.L^-1KBH4的6mol.L^-1KOH溶液中80℃处理8h,通过MH电极的放电容量,充
制备了仲钨酸钠Na10H2W12O42.27H2O,用X射线衍射Raman光谱及化学分析进行了表征,热分析的研究表明,该化合物热分解过程包括六个步骤,其中前四为脱水步骤,温度分别为331.353.403及588K左右,而失水数分别为10H2O,9H2O,5H2O及4H2O,第五步可能为中间
建立了低浓度三分子模型双曲型反应-扩散的波动方程,研究了定态的稳定性,重点研究了Turing不稳定问题,指出双曲型方程的Turing不稳定不受扩散系数不相等这一条件的约束,进而对方程作近似的分支
选择多种有机物,对Cr^6+离子与有机物共存污染体系的光催化氧化还原协同作用研究,得出了光催化应用于消除有毒金属离子与有机污染物共存实际体系的有关信息,在酸性条件下,TiO2对Cr^6+离子污染具
运用电化学暂态方法和现场时间分辨FTIR反射光谱研究甲酸在Pt(100)单晶电极上的解离吸附和氧化过程,深入认识了甲酸解离吸附的反应速率在-0.25至0.25V电位区间呈火山形变化的规律。根据电化学现场时
利用半经验AM1方法,研究了乙烯基乙炔与一氧化氮反应生成丙炔膜和丙烯腈的两第竞争反应途径。采用Berny梯度法优化得到了反应势能面上的所有驻点,并逐一进行了振动分析确认。结果表明,反
塑性有机固体的^1H MAS NMR谱通常由一高分辨谱与一宽线谱组成,其中高分辨谱分量对应于塑性相,而宽线谱分量对应于刚性相。长延迟回波-MAS NMR实验可测得塑性相的高分辨谱,CRAMPS方法可测得整个固体