【摘 要】
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对新型鸭肝炎病毒(DHV)GD1 株 VP1 结构蛋白基因进行了扩增、克隆及序列测定.采用DNAStar Protean软件对VP1蛋白的二级结构、可塑性、亲水性、表面可能性及抗原指数等参数进
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对新型鸭肝炎病毒(DHV)GD1 株 VP1 结构蛋白基因进行了扩增、克隆及序列测定.采用DNAStar Protean软件对VP1蛋白的二级结构、可塑性、亲水性、表面可能性及抗原指数等参数进行分析,综合预测其B细胞表位分布.结果表明,VP1基因长720 bp,编码240个氨基酸.与国内和韩国分离的新型毒株的氨基酸序列相似性最高,分别为99.6%,92.9%和92.5%.与台湾新型DHV的序列相似性均较低,分别为80.6%,80.2%,与传统的Ⅰ型DHV毒株的序列相似性最低,相似度仅为25.5%.较1型DHV存在多个氨基酸的插入和较多氨基酸位点的突变,高变区主要集中在180～220位.VP1结构蛋白的二级结构较为复杂,含有较多的β片层结构和转角结构,有多个区域为B细胞优势表位.该方法预测的B细胞表位结果有较高的准确度,为试验确定新型DHV毒株的VP1结构蛋白的B细胞表位和新的多表位疫苗设计提供了理论基础.
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