【摘 要】
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针对基因功能分类体系Gene Ontology的层次结构特点,修改关联规则挖掘算法Apriori,开发'挖掘与基因差异表达关联的GO功能组合'软件(RuleGO).RuleGO以基因表达谱上的
【机 构】
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哈尔滨医科大学生物信息系,哈尔滨医科大学生物信息系
【基金项目】
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国家自然科学基金资助项目 ( 3 9970 3 97,3 0 170 5 15 );国家高技术“863”计划资助项目 ( 2 0 0 2AA2 2 2 0 5 2 ,2 0 0 3AA2Z2 0 5 1);黑龙江科技攻关重点项目 (GB0 3C60 2 4);哈尔滨市科技攻关项目( 2 0 0 3AA3CS113 );黑龙江自然科学基金资助项目 (F0 1
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针对基因功能分类体系Gene Ontology的层次结构特点,修改关联规则挖掘算法Apriori,开发'挖掘与基因差异表达关联的GO功能组合'软件(RuleGO).RuleGO以基因表达谱上的差异表达基因集合和不差异表达基因集合为输入,输出组合特征功能类与基因差异表达现象的关联规则,有助于解释基因差异表达现象的本质原因,如疾病发病机制、药物作用机理等.将RuleGO和OntoExpress应用在结肠癌和腺癌表达谱数据集上,结果显示,RuleGO比OntoExpress能发现更多的与差异表达
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