【摘 要】
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目的 探索影响三阴性乳腺癌(TNBC)对化疗敏感性的分子靶标及机制,为TNBC中基于基因检测的化疗方案提供重要依据.方法 采用美国国家生物技术中心(NCBI)关于TNBC对化疗敏感性研
【机 构】
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中国医学科学院北京协和医学院生物医学工程研究所, 天津,300192
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目的 探索影响三阴性乳腺癌(TNBC)对化疗敏感性的分子靶标及机制,为TNBC中基于基因检测的化疗方案提供重要依据.方法 采用美国国家生物技术中心(NCBI)关于TNBC对化疗敏感性研究的基因表达谱数据(GSE43502),利用R编程语言对表达谱数据进行预处理,得到化疗后复发的TNBC患者相对于未复发患者的差异表达基因;基于DAVID数据库对差异表达基因进行功能富集分析,通过starBase数据库筛选出可能调控差异表达基因的miRNA,利用Cytoscape构建miRNA-基因调控网络.结果 得到了312个差异表达基因,它们主要富集于细胞膜结构、金属离子稳态等生物过程及与免疫和炎症相关的通路;筛选了171个可能调控差异表达基因的miRNA,它们与差异表达基因构成了553个miRNA-基因调控关系对.结论 hsa-miR-30d-5p、SIX4等可能通过影响细胞结构或者免疫系统来调节TNBC对化疗的敏感性.
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