棉花生长素应答因子克隆和序列分析

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通过电子克隆和RACE相结合的方法,从陆地棉中克隆到一个新ARF基因。序列分析表明,该基因序列全长为2393其中包括87bp的5′非编码区(5′UTR),1941bp的蛋白质编码区,终止密码子TAA和362bp的3′非编码区。该基因可编码647个氨基酸的蛋白质,分子量为71.9kD,等电点(PI)为8.2。该基因含有一个与拟南芥中ARF基因相似的B3结构域和一个Auxin_resp结合位点,表明该基因与拟南芥ARF基因有很高的同源性,推测具有相似或相同的功能。 A new ARF gene was cloned from upland cotton by a combination of electronic cloning and RACE. Sequence analysis showed that the full length of this gene was 2393, including 87bp 5’UTR, 1941bp protein coding region, stop codon TAA and 362bp 3 ’noncoding region. The gene encodes a 647 amino acid protein with a molecular weight of 71.9 kD and an isoelectric point (PI) of 8.2. The gene contains a B3 domain similar to the ARF gene in Arabidopsis thaliana and an Auxin_resp binding site, indicating that the gene has high homology with the Arabidopsis ARF gene and presumed to have similar or identical functions.
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