【摘 要】
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为阐明马PPAR-γ基因的结构及功能,采用DNAMAN软件对马的PPAR-γ基因序列进行初步的生物信息学研究分析。结果表明:完整的马PPAR-γ基因开放阅读框序列为1 584 bp,编码528个
【机 构】
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赤峰学院生命科学学院; 赤峰出入境检验检疫局; 青岛农业大学动物科技学院; 内蒙古农业大学动物科学学院内蒙古自治区蒙古马遗传资源保护及马产业工程实验室;
【基金项目】
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内蒙古自治区科学技术厅博士基金项目(2015BS0310);内蒙古自治区科学技术厅“内蒙古自治区马业科学工程技术研究中心”建设(201603002);内蒙古自治区自然科学基金重大项目(2017ZD06)
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为阐明马PPAR-γ基因的结构及功能,采用DNAMAN软件对马的PPAR-γ基因序列进行初步的生物信息学研究分析。结果表明:完整的马PPAR-γ基因开放阅读框序列为1 584 bp,编码528个氨基酸,预测的马PPAR-γ分子量为60 KD,等电点为6.01。马PPAR-γ基因编码区使用次数最多的密码子是编码赖氨酸(K)的AAG(22次),密码子使用偏倚程度为0%-44%。马PPAR-γ氨基酸中以亮氨酸出现次数最多(54次),出现次数最少的为色氨酸(2次)。马的PPAR-γ的二级结构以无规则卷曲为主,α螺旋和β折叠为辅。马的PPAR-γ多肽链的整体疏水性较弱,但在437-443处出现一典型疏水峰,在430-452氨基酸残基区域存在一典型的跨膜区。该研究结果为揭示PPAR-γ基因在马脂代谢中的作用奠定了基础。
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