【摘 要】
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目的对来自10个国家和中国4个省不同时间分离的69株ECHO6病毒VP1区基因特征进行分析。方法在GenBank,EMBL和DDBJ 3个基因库中进行BLASTN搜索,共得到69株ECHO6病毒基因可用,用
【机 构】
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云南省疾病预防控制中心免疫规划科,
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目的对来自10个国家和中国4个省不同时间分离的69株ECHO6病毒VP1区基因特征进行分析。方法在GenBank,EMBL和DDBJ 3个基因库中进行BLASTN搜索,共得到69株ECHO6病毒基因可用,用Mega软件计算病毒基因同源性并构建基因进化树。结果 69株ECHO6病毒可分为4个基因型(基因型A～D),C基因型又可分为7个亚型,D基因型可分为8个亚型。不同毒株的核苷酸差异率为10.6%～24.5%(氨基酸差异率为0.8%～7.3%),不同基因型之间的核苷酸差异率为17.6%～22.4%(氨基酸差异率3.5%～6.6%)。结论 ECHO6不同基因型/亚型可以在同一个地区流行很长时间,同一时间内不同的基因型/亚型又可在不同的地区流行,具有明显的时间和地域流行特点。
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