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直辖以来，重庆市科技事业发展取得了长足进步。取得家蚕基因组、超声聚焦刀、手机“通芯一号”芯片等一批重大原始性创新成果。在机械传动、烧伤创伤、交通工程、微机电系统、镁合金等领域形成了一批国际国内有影响的优势学科和创新团队。全市综合科技进步水平排位从2000年的第20位上升到第10位，科技发展的基础得到了进一步夯实，具备了自主创新的一定基础和条件。主要表现在以下几个方面：