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医学研究离不开方法论的指导。医学研究方法可以分为整个医学研究所依循的理论构建和具体医学手段研究过程中的操作原则两个层次，后者受前者指导和制约。最佳的医学研究方法不是后者而是前者。即最佳医学研究方法就是确立一个充分体现人类理性精神而不是满足于现有有利的技术手段的宏观的医学理论形态，亦即建立最佳的“医学模式”。文章提出并初步论证了“大生态医学模式”这种理论构建取代“生物医学模式”和“生物—心理—社会医学模式”的合理性。