【摘 要】
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目的 分析结核分枝杆菌北京基因型菌株与非北京基因型菌株间差异表达的蛋白质,寻找可用于快速区分北京基因型的分型标志.方法 应用间隔寡核苷酸分型法对56株结核分枝杆菌进行
【机 构】
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上海中医药大学病原生物学教研室,上海交通大学附属第一人民医院病理科,复旦大学附属华山医院传染科,同济大学附属肺科医院上海市结核重点实验室,复旦大学生命科学学院遗传学研究所
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目的 分析结核分枝杆菌北京基因型菌株与非北京基因型菌株间差异表达的蛋白质,寻找可用于快速区分北京基因型的分型标志.方法 应用间隔寡核苷酸分型法对56株结核分枝杆菌进行基因分型,经双向电泳技术比较北京基因型菌株与非北京基因型菌株的全菌蛋白表达图谱差异,差异表达的蛋白质通过基质辅助激光解吸-电离飞行时间质谱仪进行质谱分析,蛋白质数据库进行检索.进而对差异表达的蛋白质相应基因及上游进行序列分析.结果 56株结核分枝杆菌中有49株为北京型菌株,7株为非北京型菌株.两个基因型菌株中差异明显表达的蛋白质为Rv0927c,该蛋白质斑点在49株北京基因型菌株中均缺失,而在7株非北京菌株和H37Rv中均有出现.北京基因型菌株Rv0927c基因有两个特征性突变:在421位核苷酸位点的AGC 3个碱基缺失,以及该基因上游127位点G→A的突变;而非北京基因型菌株该基因及其上游序列与H37Rv完全相同.结论 Rv0927c基因在北京基因型菌株中的特征性突变,对开发新型区分北京基因型和非北京基因型结核分枝杆菌的方法奠定了基础.
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